碳市場中，第三方核查機構(gòu)起著非常重要的作用。例如，美國東部地區(qū)溫室氣體倡議(Regional Greenhouse Gas Initiative，簡稱RGGI)市場委托第三方機構(gòu)參與監(jiān)管可以解決政府內(nèi)部技術(shù)及專業(yè)監(jiān)管力量不足等難題。核證機構(gòu)的核證行為決定了出讓人的碳排放權(quán)是否可以進行交易，是保證碳排放權(quán)交易制度公正性和科學性的關鍵，核證機構(gòu)必須嚴格遵循法定程序和業(yè)務要求，審慎履行職責。如果核證機構(gòu)嚴重不負責任，為了牟取非法利益出具虛假的核證報告，甚至與被核證的交易主體勾結(jié)起來欺詐社會公眾，逃避監(jiān)管，無疑會對相關方造成嚴重損害，違背碳排放權(quán)交易制度設立的初衷。因此，應加強對核證機構(gòu)的監(jiān)管，制定《碳市場交易第三方機構(gòu)管理辦法及核查指南》，規(guī)定碳排放第三方核查機構(gòu)的準入制度和核查標準，明確第三方核查機構(gòu)的工作程序和流程，建立核查機構(gòu)評級制度、保密制度等，建立碳排放評價標準體系和監(jiān)測報告核查體系以及相應罰則等內(nèi)容，規(guī)范第三方核查機構(gòu)核查行為。

真實、準確、全面的碳排放數(shù)據(jù)是建立碳排放權(quán)交易體系最重要的基礎。對于一個交易無形產(chǎn)品的市場來說，市場參與者的信任無疑是非常重要的，任何在碳排放數(shù)據(jù)上的弄虛作假，將打擊市場參與者的信心。因此，應制定部門規(guī)章——《企業(yè)碳排放信息報告與核查實施細則》，以建立完善的碳排放數(shù)據(jù)報告制度，確保報告流程的規(guī)范、報告數(shù)據(jù)的質(zhì)量和數(shù)據(jù)核查的獨立客觀。建立較為完善的政府監(jiān)管抽查機制，賦予政府主管部門對企業(yè)的碳排放報告和核查機構(gòu)的核查報告進行隨機抽查的權(quán)限，嚴厲查處“造假者”。